בשבועות תש"ח, בעיצומה של מלחמת העצמאות, נלב"ע האדמו"ר מגור רבי אברהם מרדכי אלתר, ונטמן בקבורה זמנית בחצר ישיבת 'שפת אמת' במרכז העיר ירושלים סמוך לשוק מחנה יהודה (כיון שהימים ימי מלחמה לא התאפשרה קבורתו בהר הזיתים במערה שרכש שנים קודם לכן. עד היום נשאר שם מקום מנוחתו, ואף לימים נקבר לצידו בנו הצעיר רבי פינחס מנחם אלתר).
ידועה מטבע הלשון המיוחסת לו 'אזניים לכותל', דהיינו שכביכול הכותל המערבי מאזין ודרכו שומע הקב"ה תפילות ישראל המתרפקים על אבניו, זאת על פי מה שכתב לבני משפחתו באניה בחזרתו מביקורו הראשון בארץ בז' באייר תרפ"א: "כותל המערבי, אשר עליו אמרו חז"ל כי 'לא זזה שכינה' וכו', והבנתי כי זה הרמז במה שאמרו חז"ל (מדרש תהלים, מזמור ז): 'אזניים לכותל', ושפכתי שיח לפני בוחן לִבות… שניוַשע בכל העניינים".
{עוד מתורתו על הכותל בדף ע"י הקרן למורשת הכותל}