בט' בתמוז ה'תשכ"ח (5.7.1968), שעות ספורות לאחר שהוביל בהצלחה מאבק לשמירה על קדושת הכותל מפני קבוצה שולית שניסתה לשנות את סדרי התפילה במקום – נקרא הרב גץ לשר הדתות וקיבל את התפקיד.
בדמותו הייחודית הפך הרב מאיר יהודה גץ זצ"ל את הכותל לביתו של כלל העם היהודי. הרב היה בין הדוחפים לחשיפת מנהרות הכותל וייסד בית הכנסת מול קודש הקודשים, בו נהג לומר תיקון חצות מידי לילה.
